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Print method for class "hms".

Usage

# S4 method for hms
print(x, ...)

Arguments

x
  • hms s4 object

...
  • other print arguments

Value

It does not return anything. The obvious side effect is output to the terminal.

Examples

f <- function(x) x
result <- hms(fitness = f, lower = -5, upper = 5)
#> A list of standard deviations (sigma) or a function to create population should be provided.
#> Metaepoch: 0 Best fitness: 4.832732 
#> Metaepoch: 1 Best fitness: 4.986528 
#> Metaepoch: 2 Best fitness: 4.991225 
#> Metaepoch: 3 Best fitness: 4.999323 
#> Metaepoch: 4 Best fitness: 4.999323 
#> Metaepoch: 5 Best fitness: 4.999323 
#> Metaepoch: 6 Best fitness: 4.999484 
#> Metaepoch: 7 Best fitness: 4.999484 
#> Metaepoch: 8 Best fitness: 4.999484 
#> Metaepoch: 9 Best fitness: 4.999783 
print(result)
#> Formal class 'hms' [package "hmsr"] with 11 slots
#>   ..@ root_id                        : chr "4386e87a-32ad-4482-9a1d-303378a406cc"
#>   ..@ metaepoch_snapshots            :List of 10
#>   .. ..$ :Formal class 'MetaepochSnapshot' [package "hmsr"] with 7 slots
#>   .. .. .. ..@ demes              :List of 2
#>   .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Deme' [package "hmsr"] with 13 slots
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ id                          : chr "4386e87a-32ad-4482-9a1d-303378a406cc"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ population                  : num [1:60, 1] 1.805 -4.05 -0.129 2.043 2.536 ...
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ fitness_values              : num 1.8
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ level                       : num 1
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitness                : num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solution               : Named num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solutions_per_metaepoch:List of 1
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : Named num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitnesses_per_metaepoch:List of 1
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ sprout                      : NULL
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ parent_id                   : NULL
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ evaluations_count           : num 254
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ is_active                   : logi TRUE
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ context                     : list()
#>   .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Deme' [package "hmsr"] with 13 slots
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ id                          : chr "0b9e0038-c55b-4c1c-94db-8d0f22e592b2"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ population                  : num [1:30, 1] 4.9 4.94 4.83 4.66 4.82 ...
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "dimnames")=List of 2
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..$ : chr [1:30] "" "" "" "" ...
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..$ : chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ fitness_values              : NULL
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ level                       : num 2
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitness                : num(0) 
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solution               : num(0) 
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solutions_per_metaepoch: list()
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitnesses_per_metaepoch: list()
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ sprout                      : Named num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ parent_id                   : chr "4386e87a-32ad-4482-9a1d-303378a406cc"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ evaluations_count           : num 0
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ is_active                   : logi TRUE
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ context                     : list()
#>   .. .. .. ..@ best_fitness       : num 4.83
#>   .. .. .. ..@ best_solution      : Named num 4.83
#>   .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. ..@ time_in_seconds    : num 0.00685
#>   .. .. .. ..@ fitness_evaluations: num 254
#>   .. .. .. ..@ blocked_sprouts    : list()
#>   .. .. .. ..@ is_evolutionary    : logi TRUE
#>   .. ..$ :Formal class 'MetaepochSnapshot' [package "hmsr"] with 7 slots
#>   .. .. .. ..@ demes              :List of 3
#>   .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Deme' [package "hmsr"] with 13 slots
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ id                          : chr "4386e87a-32ad-4482-9a1d-303378a406cc"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ population                  : num [1:60, 1] 4.45 4.8 3.82 2.56 3.68 ...
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ fitness_values              : num 4.45
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ level                       : num 1
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitness                : num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solution               : Named num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solutions_per_metaepoch:List of 2
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : Named num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : Named num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitnesses_per_metaepoch:List of 2
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ sprout                      : NULL
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ parent_id                   : NULL
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ evaluations_count           : num 511
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ is_active                   : logi TRUE
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ context                     : list()
#>   .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Deme' [package "hmsr"] with 13 slots
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ id                          : chr "0b9e0038-c55b-4c1c-94db-8d0f22e592b2"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ population                  : num [1:30, 1] 4.64 4.72 4.95 4.44 4.97 ...
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ fitness_values              : num 4.64
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ level                       : num 2
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitness                : num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solution               : Named num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solutions_per_metaepoch:List of 1
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : Named num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitnesses_per_metaepoch:List of 1
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ sprout                      : Named num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ parent_id                   : chr "4386e87a-32ad-4482-9a1d-303378a406cc"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ evaluations_count           : num 133
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ is_active                   : logi TRUE
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ context                     : list()
#>   .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Deme' [package "hmsr"] with 13 slots
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ id                          : chr "c65f5114-aeef-41a9-8a17-304b1dab5661"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ population                  : num [1:15, 1] 4.86 4.95 4.96 4.99 4.97 ...
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "dimnames")=List of 2
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..$ : chr [1:15] "" "" "" "" ...
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..$ : chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ fitness_values              : NULL
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ level                       : num 3
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitness                : num(0) 
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solution               : num(0) 
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solutions_per_metaepoch: list()
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitnesses_per_metaepoch: list()
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ sprout                      : Named num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ parent_id                   : chr "0b9e0038-c55b-4c1c-94db-8d0f22e592b2"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ evaluations_count           : num 0
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ is_active                   : logi TRUE
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ context                     : list()
#>   .. .. .. ..@ best_fitness       : num 4.99
#>   .. .. .. ..@ best_solution      : Named num 4.99
#>   .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. ..@ time_in_seconds    : num 0.0111
#>   .. .. .. ..@ fitness_evaluations: num 644
#>   .. .. .. ..@ blocked_sprouts    :List of 1
#>   .. .. .. .. ..$ : Named num 4.83
#>   .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. ..@ is_evolutionary    : logi TRUE
#>   .. ..$ :Formal class 'MetaepochSnapshot' [package "hmsr"] with 7 slots
#>   .. .. .. ..@ demes              :List of 4
#>   .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Deme' [package "hmsr"] with 13 slots
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ id                          : chr "4386e87a-32ad-4482-9a1d-303378a406cc"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ population                  : num [1:60, 1] 4.26 3.78 4.49 4.37 4.42 ...
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ fitness_values              : num 4.26
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ level                       : num 1
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitness                : num 4.97
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solution               : Named num 4.97
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solutions_per_metaepoch:List of 3
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : Named num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : Named num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : Named num 4.97
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitnesses_per_metaepoch:List of 3
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : num 4.97
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ sprout                      : NULL
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ parent_id                   : NULL
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ evaluations_count           : num 759
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ is_active                   : logi TRUE
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ context                     : list()
#>   .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Deme' [package "hmsr"] with 13 slots
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ id                          : chr "a89d8585-2bd6-48ad-abb1-bc6644936803"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ population                  : num [1:30, 1] 4.9 4.68 4.54 4.96 4.92 ...
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "dimnames")=List of 2
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..$ : chr [1:30] "" "" "" "" ...
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..$ : chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ fitness_values              : NULL
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ level                       : num 2
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitness                : num(0) 
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solution               : num(0) 
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solutions_per_metaepoch: list()
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitnesses_per_metaepoch: list()
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ sprout                      : Named num 4.97
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ parent_id                   : chr "4386e87a-32ad-4482-9a1d-303378a406cc"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ evaluations_count           : num 0
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ is_active                   : logi TRUE
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ context                     : list()
#>   .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Deme' [package "hmsr"] with 13 slots
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ id                          : chr "0b9e0038-c55b-4c1c-94db-8d0f22e592b2"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ population                  : num [1:30, 1] 4.77 4.74 -2.66 4.97 4.83 ...
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ fitness_values              : num 4.77
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ level                       : num 2
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitness                : num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solution               : Named num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solutions_per_metaepoch:List of 2
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : Named num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : Named num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitnesses_per_metaepoch:List of 2
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ sprout                      : Named num 4.83
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ parent_id                   : chr "4386e87a-32ad-4482-9a1d-303378a406cc"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ evaluations_count           : num 269
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ is_active                   : logi TRUE
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ context                     : list()
#>   .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Deme' [package "hmsr"] with 13 slots
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ id                          : chr "c65f5114-aeef-41a9-8a17-304b1dab5661"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ population                  : num [1:15, 1] 4.99 4.98 4.98 4.98 4.99 ...
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ fitness_values              : num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ level                       : num 3
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitness                : num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solution               : Named num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_solutions_per_metaepoch:List of 1
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : Named num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ best_fitnesses_per_metaepoch:List of 1
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..$ : num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ sprout                      : Named num 4.99
#>   .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ parent_id                   : chr "0b9e0038-c55b-4c1c-94db-8d0f22e592b2"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ evaluations_count           : num 65
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ is_active                   : logi TRUE
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ context                     : list()
#>   .. .. .. ..@ best_fitness       : num 4.99
#>   .. .. .. ..@ best_solution      : Named num 4.99
#>   .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. ..@ time_in_seconds    : num 0.0141
#>   .. .. .. ..@ fitness_evaluations: num 1093
#>   .. .. .. ..@ blocked_sprouts    :List of 1
#>   .. .. .. .. ..$ : Named num 4.99
#>   .. .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr "x1"
#>   .. .. .. ..@ is_evolutionary    : logi TRUE
#>   .. ..$ :Formal class 'MetaepochSnapshot' [package "hmsr"] with 7 slots
#>   .. .. .. ..@ demes              :List of 4
#>   .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Deme' [package "hmsr"] with 13 slots
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ id                          : chr "4386e87a-32ad-4482-9a1d-303378a406cc"
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ population                  : num [1:60, 1] 4.54 2.16 3.77 4.48 3.38 ...
#>   .. .. .. .. .. .. ..@ fitness_values              : num 4.54
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